เช่นเดียวกับซาลาแมนเดอร์อื่นๆ ซาลาแมนเดอร์ยักษ์ญี่ปุ่นจะ หายใจ ผ่านทางผิวหนังเป็นหลัก ผิวหนังเรียบทำหน้าที่เป็นพื้นผิวทางเดินหายใจสำหรับการแลกเปลี่ยนก๊าซ โดยที่ออกซิเจนเข้าสู่ร่างกายและปล่อยก๊าซคาร์บอนไดออกไซด์ออกมา ผิวหนังหรือริ้วรอยขยายเพิ่มพื้นที่ผิวสำหรับการหายใจนี้ ซาลาแมนเดอร์เหล่านี้มีปอดข้างเดียว แต่ใช้เพื่อควบคุมการลอยตัวในน้ำเป็นหลัก   ความรู้ทั่วไปซาลาแมนเดอร์ยักษ์  เมื่อมีอาการรุนแรงหรือเครียด ซาลาแมนเดอร์ยักษ์ญี่ปุ่นจะหลั่งเมือกสีขาวเหนียวๆ ออกมาซึ่งอาจเป็นพิษต่อสัตว์นักล่า สารคัดหลั่งเหนียวมีกลิ่นฉุนและมีกลิ่นคล้ายพริกไทยญี่ปุ่น ทำให้มีชื่อสามัญในญี่ปุ่นว่า ปลาพริกไทยตัวใหญ่ ซาลาแมนเดอร์ยักษ์มีความสามารถในการฟื้นฟูที่น่าทึ่ง และสามารถฟื้นฟูผิวหนังและกระดูกได้หากจำเป็น ซาลาแมนเดอร์ยักษ์ญี่ปุ่นอยู่ในตระกูล Cryptobranchid ซึ่งประกอบด้วยซาลาแมนเดอร์ที่แตกต่างกันสามชนิดตามภูมิภาค ซาลาแมนเดอร์ยักษ์ญี่ปุ่น ซาลาแมนเดอร์ยักษ์จีน และเฮลล์เบนเดอร์ในอเมริกาเหนือ